L'arcipelago di Karimunjawa protegge 27 isole all'interno di un parco nazionale marino di 110.000 ettari, istituito nel 1986 per proteggere le formazioni coralline che si classificano tra le più ricche di biodiversità di Java. Cinque isole ospitano insediamenti permanenti; le restanti rimangono atolli boscosi circondati da sabbia bianca e scogliere che scendono in canali profondi 40 metri. La designazione del parco è arrivata dopo decenni di pressione della pesca commerciale e oggi le sue acque ospitano oltre 240 specie di coralli e 133 generi di pesci di barriera, dai banchi di fucilieri ai solitari pesci Napoleone che pattugliano le scarpate. I paket snorkeling Karimunjawa partono solitamente dal porto principale dell'isola di Karimunjawa, dove phinisi in legno e motoscafi in vetroresina si mettono in fila all'alba. La maggior parte degli itinerari prevede quattro o cinque siti: i giardini poco profondi di Menjangan Kecil, i prati di alghe di Cemara Besar dove riposano gli squali pinna nera giovani, i canali di Tengah Island e il relitto sommerso al largo di Cemara Kecil che funge da barriera artificiale. La visibilità dell'acqua varia in media dai 15 ai 25 metri durante la stagione secca da aprile a ottobre, quando i venti alisei di sud-est si placano e le fioriture di plancton diminuiscono. Il parco marino richiede una tassa di conservazione di 150.000 IDR per visitatore straniero al giorno, riscossa nei punti di ingresso e valida in tutte le zone. I tour di snorkeling nel parco marino di Karimunjawa operano dalle 08:00 alle 16:00 tutti i giorni, in sintonia con le maree che portano acqua oceanica più fresca nelle lagune. I pacchetti multi-giorno includono pernottamenti sulle isole di Karimunjawa o Kemujan, dove le pensioni si raggruppano vicino ai moli. Gli itinerari giornalieri ritornano a Jepara nel tardo pomeriggio, coprendo da cinque a sei soste per lo snorkeling in otto ore. Gli operatori forniscono maschere, pinne e maglie protettive; fotocamere subacquee e mute sono a pagamento. L'autorità del parco limita le dimensioni dei gruppi a 15 snorkelisti per guida e proibisce di toccare i coralli o dare da mangiare ai pesci, regole fatte rispettare dai ranger di stanza sulle barche di pattuglia. A settembre le temperature dell'acqua si aggirano intorno ai 28°C, abbastanza calde per un'immersione prolungata senza protezione termica. I pacchetti solitamente comprendono il trasporto in barca, l'attrezzatura da snorkeling, il pranzo su un banco di sabbia e l'ingresso al parco. I tour island-hopping aggiungono soste in spiaggia su isolotti disabitati e kayak tra le mangrovie nei canali di marea di Kemujan. Gli itinerari di quattro giorni includono snorkeling all'alba, immersioni notturne per vedere il plancton bioluminescente e passeggiate nel villaggio lungo i vicoli ombreggiati dal teak della città di Karimunjawa. I prezzi riflettono il tipo di barca, le dimensioni del gruppo e le inclusioni del pernottamento, ma tutti gli itinerari attraversano le stesse scogliere protette.